Lt.jg. Phlix übernahm die Koordination der Suchaktion, mit deren Planung bereits in der letzten Alpha-Schicht begonnen worden war. Die Suche nach den 20 verschwundenen Shuttles [NPS] und den vermissten Offizieren der U.S.S. Gettysburg stellte sich jedoch aufgrund des großen zu durchsuchenden Gebiets als sehr zeitintensiv und zunächst auch als unproduktiv heraus. Lt.-Cmdr. Brown begab sich zu Lt.sg. Tro [NPC], um, wie von Cpt. Bre in der letzten Alpha-Schicht angeordnet, mit dem Lieutenant über Strategien und Vorgehensweisen von Cpt. T'Ran [NPC] zu sprechen, welche bei der Suche helfen könnten. Zunächst gab sich der Lieutenant recht verschlossen, da er seiner Familie nicht schaden wollte, doch als Lt.-Cmdr. Brown über den Vorfall berichtete, den es vermutlich mit dem Außenteam um Lt.-Cmdr. Savall und Lt.jg. Pion gegeben hatte, war Lt.sg. Tro gesprächsbereiter. Schließlich verriet er Lt.-Cmdr. Brown eine Codierungssequenz, die beim Auffinden der 20 Shuttles trotz maskierter Warpsignaturen helfen könnte. Die Codierungssequenz stellte sich zumindest teilweise als richtig heraus. Ein Teil der Sequenz schien vor der Maskierung der Warpsignaturen geändert worden zu sein. Somit war es möglich, das Suchgebiet auf circa 25% des ursprünglichen Suchgebiets einzugrenzen. Die Suchflotte unter der Leitung der U.S.S. Gettysburg setzte sofort Kurs auf das verkleinerte Suchgebiet und setzte die Suche dort mit einem engmaschigeren Netz fort.
In der Zwischenzeit hatte sich Cpt. Bre seine Analyse der von Lt.jg. Pion gesendeten medizinischen Daten noch einmal genau angeschaut und war stutzig geworden, da bislang noch kein Parasit so schnell mutieren konnte, wie es der vorliegende Parasit anscheinend getan hatte. Cpt. Bre unterzog diese Daten einer gründlicheren Analyse. Es stellte sich später heraus, dass es im Gegensatz zur ersten Vermutung kein Parasit, sondern ein Virus war, der die bekannten Symptome hervorgerufen hat. Mit dieser Erkenntnis ließ sich auch die Fähigkeit zu schnellen Mutationen erklären. Das Virus tarnte sich nur als Parasit, da das Virus eine gewisse instinktive Intelligenz zu besitzen schien und etwas gegen die Behandlungsmethoden von Lt.jg. Pion, die sein Leben bedrohten, unternehmen musste. Es war zunächst noch fraglich, wie das Virus so intelligent sein kann. Wenig später konnte die Hypothese aufgestellt werden, dass dieses Virus sich der Leistung von Nervenzellen im Gehirn bedienen und diese so codieren kann, dass diese zumindest für kurze Zeit für das Virus arbeiten. Des Weiteren fand Cpt. Bre noch heraus, dass Teile der von Lt.jg. Pion gesendeten Daten keinen Sinn ergaben, was letztlich mit der Hypothese erklärt werden konnte, dass das Virus vermutlich mit Hilfe einiger Nervenzellen von Lt.jg. Pion einige Untersuchungsergebnisse in den Scandaten gefälscht hatte, um mit Hilfe des Großteils an stimmigen Daten von sich abzulenken. Die medizinische Abteilung wurde mit Hilfe der neuen Erkenntnisse beauftragt, herauszufinden, ob es nun möglich war, eine Behandlung zu entwickeln. Dies war zwar letztlich möglich, doch würde diese Behandlung aufgrund der verfälschten Daten nur für wenige Stunden wirken. Es schien also nötig, die betroffenen Personen nach der Rettung mehrmals zu behandeln, um das Virus endgültig zerstören zu können.
Das Außenteam befand sich zunächst weiterhin in dem komatösen Zustand, welcher der U.S.S. Gettysburg als Hypothese bereits in der letzten Alpha-Schicht bekannt geworden war. Ein Mitglied des [NPC-]MO-Teams an Bord von Cpt. T'Rans Shuttle wurde jedoch für wenige Minuten wach und es gelang ihm, ein Positionssignal zu senden, bevor das Virus wieder die Kontrolle über den [NPC-]MO übernahm. Die U.S.S. Gettysburg fing das Positionssignal auf und änderte umgehend den Kurs. Obwohl die U.S.S. Gettysburg mit Hilfe der 30 Shuttles [NPS] taktisch überlegen war, initiierten die 20 nun gefundenen Shuttles eine taktische Situation, da sich deren Insassen nicht ergeben wollten. Als deutlich wurde, dass die U.S.S. Gettysburg die taktische Situation für sich entscheiden würde, gingen 19 der 20 Shuttles auf Warp, maskierten ihre Warpsignatur aber dieses Mal nicht. Da diverse Systeme ihres Shuttles in der vorangegangenen taktischen Situation irreparabel beschädigt worden waren, initiierte Cpt. T'Ran die Selbstzerstörung ihres Shuttles. Das Außenteam der U.S.S. Gettysburg befand sich weiterhin an Bord dieses Shuttles, konnte jedoch kurz vor der Selbstzerstörung des Shuttles an Bord gebeamt werden. Das Außenteam wurde bis zu einer ersten Untersuchung unter Quarantänebedingungen vorerst in den Isolierbereich in Frachtraum 1 gebeamt, welcher noch nicht demontiert worden war.